265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2985 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 164 aa  339  8e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  62.58 
 
 		 164 aa  221  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  65.41 
 
 		 166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  62.96 
 
 		 164 aa  213  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  61.59 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  61.88 
 
 		 162 aa  208  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  60.12 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  61.21 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  57.58 
 
 		 166 aa  196  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  55 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  55.62 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  52.8 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  50.6 
 
 		 167 aa  163  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  52.8 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 194 aa  157  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  52.47 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  48.54 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  44.64 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  52.03 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 194 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  46.11 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 163 aa  147  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 219 aa  146  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  46.25 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 171 aa  143  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 209 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 259 aa  141  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  43.53 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  40.35 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  51.32 
 
 		 171 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  44 
 
 		 186 aa  130  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 186 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  43.2 
 
 		 178 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  41.77 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  43.59 
 
 		 220 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  39.51 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  38.04 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 292 aa  127  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  41.96 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  41.62 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  41.96 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  46.43 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>