267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13348 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 160 aa  332  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  63.06 
 
 		 160 aa  213  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  61.78 
 
 		 164 aa  197  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  50.96 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  48.73 
 
 		 163 aa  167  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  49.35 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  44.94 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  44.59 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 161 aa  148  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 164 aa  144  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  41.03 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  48.68 
 
 		 171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  41.03 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  40.38 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 172 aa  140  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  39.49 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 166 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  42.14 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  41.83 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  45.14 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  40.51 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  38.41 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  40.79 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  40.79 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  41.06 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  43.8 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  41.14 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  37.65 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 		 178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 179 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  46.21 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  39.62 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  38.22 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  37.65 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  38.79 
 
 		 187 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  38.31 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 		 179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  37.65 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 166 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  36.71 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  39.51 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  43.94 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  38.36 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.94 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  40.79 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  43.94 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  43.26 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  35 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  41.25 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  38.04 
 
 		 160 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 166 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  37.66 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  39.62 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  40.13 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  44.83 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0378  dihydrofolate reductase FolA  38.31 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  35.54 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  43.26 
 
 		 170 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  36.71 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>