266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2381 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  100 
 
 
162 aa  330  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  85 
 
 
160 aa  289  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  69.43 
 
 
161 aa  227  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  67.08 
 
 
167 aa  227  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  68.79 
 
 
161 aa  226  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  65.82 
 
 
159 aa  217  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
164 aa  163  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 
166 aa  160  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 
164 aa  157  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 
164 aa  157  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  52.87 
 
 
158 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  53.12 
 
 
168 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 
165 aa  154  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  51.23 
 
 
168 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  51.25 
 
 
171 aa  148  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 
164 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  46.15 
 
 
167 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  44.31 
 
 
169 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  48.59 
 
 
186 aa  141  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 
163 aa  140  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  39.77 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  40.59 
 
 
175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  43.02 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  42.69 
 
 
182 aa  127  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  42.11 
 
 
181 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 
160 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 
160 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 
160 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  46.1 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  39.26 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 
220 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  43.16 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  37.65 
 
 
160 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  42.01 
 
 
167 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  42.95 
 
 
161 aa  117  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 
259 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  40 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  39.52 
 
 
167 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  35.98 
 
 
160 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 
169 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  35.58 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 
160 aa  114  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  39.52 
 
 
167 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  38.04 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  38.04 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  48 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  37.42 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  40 
 
 
195 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  40 
 
 
166 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 
176 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  36.14 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  37.06 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  48.39 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  48.39 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  38.95 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  36.2 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 
166 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  47.69 
 
 
171 aa  108  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 
169 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  44.88 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  37.8 
 
 
164 aa  107  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  44.09 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 
169 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  38.27 
 
 
170 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  40.29 
 
 
163 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  38.24 
 
 
167 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  43.7 
 
 
161 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  38.24 
 
 
209 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  36.2 
 
 
160 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  40.29 
 
 
163 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  43.62 
 
 
191 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  42.57 
 
 
174 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  38.24 
 
 
186 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  36.02 
 
 
160 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  35.37 
 
 
160 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  41.29 
 
 
292 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  44.54 
 
 
166 aa  104  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 
170 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  44.68 
 
 
179 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>