267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1963 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 183 aa  384  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  48.57 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  48.57 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  54.12 
 
 		 162 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  47.95 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  48 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  48.52 
 
 		 161 aa  170  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  42.29 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  46.59 
 
 		 166 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 160 aa  168  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  48.85 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  45.98 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 162 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  46.99 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  44.69 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  42.94 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 161 aa  157  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 162 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 160 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 160 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  46.29 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 164 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  46.29 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  154  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  154  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  154  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  44.57 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  46.75 
 
 		 164 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  45.61 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 163 aa  151  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 160 aa  151  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 165 aa  151  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  46.2 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  43.35 
 
 		 163 aa  150  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  42.46 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  45.16 
 
 		 164 aa  150  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  43.6 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  44.77 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.77 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 163 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  43.53 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  42.29 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  41.76 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 		 170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  43.53 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  41.76 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  44 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  47.95 
 
 		 172 aa  144  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  42.01 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  42.11 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  43.43 
 
 		 166 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  43.1 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 169 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  44.08 
 
 		 176 aa  141  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 162 aa  141  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  40.35 
 
 		 178 aa  140  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  42.95 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  41.04 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  43.42 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  43.6 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  47.65 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.95 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  44.23 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 167 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 167 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 167 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 167 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 167 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>