270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6098 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  65.27 
 
 		 178 aa  227  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  65.27 
 
 		 178 aa  224  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  64.07 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  65.61 
 
 		 180 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  59.88 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  64.5 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 		 169 aa  174  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 187 aa  160  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 171 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 292 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 172 aa  150  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  48.82 
 
 		 219 aa  150  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  47.62 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  46.43 
 
 		 167 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  46.43 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  46.75 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 174 aa  144  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  46.75 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  42.69 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 198 aa  140  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  38.92 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  38.92 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0603  Dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 161 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  43.86 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  38.32 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  38.32 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  41.07 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  41.18 
 
 		 183 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  41.52 
 
 		 195 aa  134  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 		 195 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  40.72 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  41.07 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  38.37 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 209 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  41.52 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  44 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  37.58 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 177 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  41.76 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  43.35 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  41.42 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  39.38 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>