265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2159 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  100 
 
 
167 aa  325  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  99.38 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  73.12 
 
 
160 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  68.79 
 
 
162 aa  226  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  69.62 
 
 
159 aa  220  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  51.52 
 
 
164 aa  167  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 
164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 
166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 
164 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  50.59 
 
 
167 aa  157  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  51.85 
 
 
168 aa  153  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  51.23 
 
 
168 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  47.67 
 
 
194 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  48.84 
 
 
194 aa  150  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  51.88 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  47.02 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 
166 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
176 aa  141  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 
165 aa  140  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  49.37 
 
 
158 aa  140  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 
163 aa  140  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  47.88 
 
 
177 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  49.12 
 
 
182 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  45.76 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  42.69 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 
175 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
165 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
166 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 
169 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  54.92 
 
 
166 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 
160 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
160 aa  120  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  44 
 
 
220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
160 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  43.8 
 
 
162 aa  117  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  43.39 
 
 
185 aa  117  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  41.92 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
160 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  50 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.12 
 
 
163 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  50.39 
 
 
161 aa  114  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  48.44 
 
 
167 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  52.85 
 
 
191 aa  114  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  50 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  39.64 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  42.01 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  45.99 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  50 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  48.18 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
167 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  50.42 
 
 
166 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 
167 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 
160 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  40.35 
 
 
176 aa  111  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 
219 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  37.58 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  37.58 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.71 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  45.19 
 
 
167 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 
160 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  49.61 
 
 
171 aa  111  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  42.42 
 
 
162 aa  111  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 
160 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  42.14 
 
 
160 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 
160 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  50.41 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  51.64 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  41.79 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  47.41 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  41.79 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  49.17 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  49.59 
 
 
173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  46.72 
 
 
259 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  41.84 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  39.05 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  47.45 
 
 
166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  46.72 
 
 
209 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  49.15 
 
 
163 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  44.52 
 
 
171 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  35.82 
 
 
162 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
174 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>