265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 175 aa  347  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  52.35 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  53.18 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  52.35 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  53.89 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  55.56 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  51.5 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  51.76 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  51.5 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  48.3 
 
 		 177 aa  154  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  46.43 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 171 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  49.72 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  43.82 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 161 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  44.64 
 
 		 168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  44.97 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  46.94 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  48.25 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  45.14 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  40.59 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  49.62 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  39.78 
 
 		 220 aa  125  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  41.98 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  49.25 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 292 aa  121  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  43.27 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  42.53 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  47.76 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  48.51 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  49.64 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  38.76 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  41.95 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  46.27 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  45.19 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  39.29 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  45.11 
 
 		 259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  41.32 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  38.69 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  38.69 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  47.18 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  40.23 
 
 		 160 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  44.06 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  42.46 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  47.37 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  47.37 
 
 		 219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  46.62 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  46.62 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  46.62 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  46.62 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  47.14 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  35.91 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  46.62 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  46.62 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  43.06 
 
 		 171 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  43.28 
 
 		 163 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  39.51 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.83 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  34.73 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  43.36 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  40.15 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  44.08 
 
 		 166 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  39.1 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  37.28 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2332  dihydrofolate reductase  36.17 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>