266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1528 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
168 aa  328  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  63.69 
 
 
171 aa  192  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  55.49 
 
 
158 aa  167  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  55.83 
 
 
159 aa  163  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  49.42 
 
 
194 aa  160  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  48.21 
 
 
181 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  53.7 
 
 
160 aa  157  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  51.85 
 
 
167 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  51.85 
 
 
161 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  55.15 
 
 
176 aa  153  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 
161 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 
162 aa  153  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  53.53 
 
 
182 aa  153  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  48.57 
 
 
186 aa  147  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  47.34 
 
 
169 aa  144  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  50 
 
 
166 aa  144  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  48.81 
 
 
167 aa  141  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  56.06 
 
 
163 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
175 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  48.23 
 
 
165 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  48.92 
 
 
166 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  47.83 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  47.9 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  43.11 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  54.74 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  48.89 
 
 
164 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  46.04 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  48.23 
 
 
191 aa  123  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  45.16 
 
 
170 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  40.82 
 
 
170 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  38.89 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  37.86 
 
 
161 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  38.98 
 
 
220 aa  114  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  47.76 
 
 
292 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  40.85 
 
 
162 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.75 
 
 
159 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  44.44 
 
 
173 aa  114  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  39.05 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  42.76 
 
 
259 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  41.84 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  43.41 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  38.65 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
166 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  43.42 
 
 
172 aa  111  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  39.07 
 
 
167 aa  111  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  41.13 
 
 
167 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 
160 aa  111  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  46.56 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.96 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  42.96 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  36.69 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  39.24 
 
 
159 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  41.43 
 
 
165 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  36.75 
 
 
163 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.18 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  44.96 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  44.19 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  38.01 
 
 
176 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  44.6 
 
 
166 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  31.29 
 
 
161 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  46.27 
 
 
166 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  41.24 
 
 
185 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  40.91 
 
 
164 aa  105  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  45.93 
 
 
171 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  40 
 
 
160 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  43.88 
 
 
187 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  40.31 
 
 
175 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 
160 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.61 
 
 
177 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  45.19 
 
 
173 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 
160 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  35.5 
 
 
160 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  43.94 
 
 
161 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 
167 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  41.94 
 
 
162 aa  104  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  34.73 
 
 
167 aa  104  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  34.73 
 
 
167 aa  104  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  40 
 
 
162 aa  104  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 
160 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  31.48 
 
 
161 aa  103  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  41.86 
 
 
160 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 
161 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 
161 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  40.91 
 
 
163 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  49.18 
 
 
177 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  42.52 
 
 
162 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  36.03 
 
 
170 aa  102  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  40.71 
 
 
172 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  42.75 
 
 
161 aa  100  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  34.07 
 
 
161 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  40.71 
 
 
172 aa  100  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  40.71 
 
 
160 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  42.65 
 
 
219 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  45.11 
 
 
195 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 
169 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>