265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0221 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 259 aa  523  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  53.99 
 
 		 166 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  54.94 
 
 		 166 aa  168  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  54.32 
 
 		 167 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  53.7 
 
 		 166 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  53.7 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  53.7 
 
 		 167 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 165 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  52.73 
 
 		 166 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  52.73 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  53.94 
 
 		 167 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 167 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 167 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 167 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 167 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 167 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  52.73 
 
 		 167 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  53.94 
 
 		 166 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  53.94 
 
 		 166 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  52.12 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  53.94 
 
 		 195 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  53.94 
 
 		 166 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 		 166 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 166 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 167 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 186 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  51.22 
 
 		 162 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 164 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 166 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  41.21 
 
 		 161 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 164 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 163 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  50.67 
 
 		 166 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 177 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 		 161 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 		 161 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 164 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 164 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 169 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  52.52 
 
 		 160 aa  138  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 		 162 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 164 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 162 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.02 
 
 		 171 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  40.8 
 
 		 171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  52.24 
 
 		 167 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  52.24 
 
 		 167 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 		 165 aa  131  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 160 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  41.92 
 
 		 165 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 162 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 160 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  47.52 
 
 		 160 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  40.12 
 
 		 161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 176 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 166 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  47.33 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 		 161 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  40.48 
 
 		 170 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 159 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 		 160 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.76 
 
 		 160 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  48.23 
 
 		 160 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  48.23 
 
 		 160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  48.23 
 
 		 160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  47.52 
 
 		 160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 171 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  47.52 
 
 		 160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  47.52 
 
 		 160 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  47.52 
 
 		 160 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 177 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  40.85 
 
 		 162 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  46.1 
 
 		 162 aa  125  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 163 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 166 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 166 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 158 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  46.85 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  40.25 
 
 		 159 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 169 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 166 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 		 195 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.22 
 
 		 174 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  49.67 
 
 		 168 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>