268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12776 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  100 
 
 		 159 aa  321  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  67.72 
 
 		 160 aa  221  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  69.62 
 
 		 167 aa  220  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  69.62 
 
 		 161 aa  220  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  68.99 
 
 		 161 aa  219  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  65.82 
 
 		 162 aa  217  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  55.83 
 
 		 168 aa  163  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  51.19 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  55 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  53.42 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  48.45 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 162 aa  145  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  49.42 
 
 		 182 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  49.09 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  53.28 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  43.35 
 
 		 194 aa  133  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 175 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  41.04 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  43.6 
 
 		 181 aa  130  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  43.02 
 
 		 186 aa  123  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  52.89 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 178 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  43.92 
 
 		 185 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  47.86 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  48.53 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  43.07 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  50.39 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 259 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  47.26 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  39.26 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  48 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  48 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  41.29 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 220 aa  114  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  38.04 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  39.53 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  44.9 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  39.44 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  38.36 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  45.26 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  46.04 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  45 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  34.76 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  41.73 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  47.41 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 292 aa  110  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  43.84 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  37.65 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  38.36 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  45.89 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  44.68 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  44.52 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 191 aa  107  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  43.36 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  43.26 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  44.68 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  41.21 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  34.75 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  38.3 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  38.3 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  43.26 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  34.75 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  41.28 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>