266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0932 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 163 aa  333  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  55.97 
 
 		 161 aa  197  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  55.77 
 
 		 160 aa  188  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  51.28 
 
 		 306 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  53.21 
 
 		 306 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 162 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  57.03 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 162 aa  158  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  49.67 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  53.91 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  44.65 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  45.28 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  45.16 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  44.23 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  44.23 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 164 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  51.85 
 
 		 164 aa  147  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 163 aa  146  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  52.34 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  45.1 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  45.4 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  51.16 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1653  Dihydrofolate reductase  48.72 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  52.34 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 183 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  44.79 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  51.56 
 
 		 160 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  51.56 
 
 		 160 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 160 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  51.56 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1890  dihydrofolate reductase region  44.38 
 
 		 166 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 178 aa  140  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  48.72 
 
 		 292 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  49.29 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  47.2 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  45.57 
 
 		 187 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  44.24 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  48.51 
 
 		 170 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  44.31 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  39.88 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 195 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 172 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 175 aa  134  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  48.23 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  46.85 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>