265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2052 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 165 aa  333  7.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  55.62 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  54.94 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 		 166 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  54.94 
 
 		 167 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  55.56 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 259 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  51.25 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  53.16 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  51.85 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  52.44 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  53.05 
 
 		 164 aa  158  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  52.47 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  52.1 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 164 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  52.47 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  52.5 
 
 		 167 aa  150  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  50.59 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  47.13 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  53.37 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  48.17 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  51.85 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  51.5 
 
 		 219 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  53.42 
 
 		 292 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  47.13 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  51.2 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  51.81 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  51.81 
 
 		 195 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  47.93 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 209 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  47.65 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  49.69 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  44.59 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  57.26 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 171 aa  137  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 164 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 		 170 aa  137  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 182 aa  137  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  57.36 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  48.21 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  40.7 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  45.58 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  54.74 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  39.26 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  38.79 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  38.79 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  45.61 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2043  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  47.68 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  44.22 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  47.24 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>