267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1761 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 158 aa  317  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  56.96 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  54.39 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  55.49 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  55.76 
 
 		 167 aa  166  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  53.89 
 
 		 175 aa  166  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  56.71 
 
 		 176 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  55 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  53.5 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  52.44 
 
 		 177 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  52.87 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  55.73 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  51.88 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  51.57 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  47.09 
 
 		 194 aa  148  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 		 164 aa  147  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  53.68 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  47.93 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  48.21 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  49.37 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  42.44 
 
 		 194 aa  140  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  49.37 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  45.61 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  55.04 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  57.36 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 259 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  41.92 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  42.17 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 220 aa  120  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  38.71 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  44.91 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  45.08 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  43.43 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  43.68 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 292 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  48.91 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 195 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  35.37 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  45.52 
 
 		 191 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  36.31 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  37.21 
 
 		 169 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  44.22 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  38.01 
 
 		 170 aa  113  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  41.4 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  34.83 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  47.37 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  40.25 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  47.69 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  38.1 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  42.36 
 
 		 171 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  37.89 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 219 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  36.9 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  33.95 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.07 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  39.26 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  35.58 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  45.93 
 
 		 209 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  43.85 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  41.48 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  36.02 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.65 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  38.24 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  43.36 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  45.26 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  35.12 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  33.94 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  35.98 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>