266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2865 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
169 aa  340  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  49.13 
 
 
167 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  49.11 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  54.93 
 
 
164 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  51.76 
 
 
177 aa  158  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  55.71 
 
 
164 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  46.55 
 
 
181 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  51.43 
 
 
162 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  54.29 
 
 
164 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  53.19 
 
 
166 aa  151  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  50.29 
 
 
182 aa  147  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  45.88 
 
 
171 aa  147  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 
164 aa  147  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  47.34 
 
 
168 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  50.99 
 
 
166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 
160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 
175 aa  143  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  48.21 
 
 
158 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  44.31 
 
 
162 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  45.83 
 
 
176 aa  140  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  51.08 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  57.26 
 
 
165 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  42.53 
 
 
194 aa  137  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  52.5 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  50.39 
 
 
166 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  49.61 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  39.08 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  48.03 
 
 
167 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  48.03 
 
 
167 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  42.69 
 
 
168 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
166 aa  121  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  47.24 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  42.68 
 
 
160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  45.67 
 
 
259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  46.22 
 
 
167 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  40.82 
 
 
175 aa  114  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  42.76 
 
 
220 aa  114  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  41.4 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  41.4 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  41.4 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 
160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  46.03 
 
 
160 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  38.5 
 
 
186 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  37.9 
 
 
162 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  48.28 
 
 
185 aa  111  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  40.32 
 
 
161 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  40.32 
 
 
161 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  39.52 
 
 
161 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 
160 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 
160 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  41.45 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  40.65 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  41.38 
 
 
161 aa  107  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  41.43 
 
 
191 aa  107  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  39.17 
 
 
164 aa  106  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  45 
 
 
165 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  43.65 
 
 
160 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  36.29 
 
 
162 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  46.72 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  42.19 
 
 
166 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  36.13 
 
 
160 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  39.22 
 
 
160 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  45.31 
 
 
167 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  43.55 
 
 
160 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  38.06 
 
 
162 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  36.29 
 
 
162 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  36.29 
 
 
162 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  36.29 
 
 
162 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  36.29 
 
 
162 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  36.29 
 
 
162 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  36.29 
 
 
162 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  36.29 
 
 
162 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  35.48 
 
 
162 aa  104  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  44.19 
 
 
170 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 
167 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 
167 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 
167 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 
167 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 
167 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 
167 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  39.61 
 
 
163 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  35.48 
 
 
162 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  41.41 
 
 
166 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  45.83 
 
 
292 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  38.16 
 
 
160 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  40.83 
 
 
163 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  44.09 
 
 
171 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  40.13 
 
 
172 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  33.93 
 
 
160 aa  101  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  41.27 
 
 
160 aa  101  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  41.8 
 
 
161 aa  101  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  48.67 
 
 
171 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  43.8 
 
 
166 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  36.24 
 
 
162 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 
172 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  43.07 
 
 
166 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  37.82 
 
 
167 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>