267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3945 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
176 aa  339  9e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  56.71 
 
 
158 aa  175  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  50 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  58.02 
 
 
171 aa  168  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  55.15 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  47.09 
 
 
194 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  47.93 
 
 
194 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  47.59 
 
 
164 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 
165 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  51.35 
 
 
166 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
164 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 
164 aa  154  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  48.21 
 
 
169 aa  154  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  48.82 
 
 
167 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  54.34 
 
 
182 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 
164 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 
175 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  51.22 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  46.39 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
161 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 
161 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 
166 aa  148  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  50.91 
 
 
159 aa  147  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
162 aa  141  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  50.98 
 
 
165 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  52.78 
 
 
169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  45.22 
 
 
163 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  46.63 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  50 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 
166 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 
167 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  43.24 
 
 
160 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  46.56 
 
 
160 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  34.53 
 
 
161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
162 aa  124  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  48.23 
 
 
165 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 
167 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 
167 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 
167 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 
167 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 
167 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  37.79 
 
 
170 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  45.98 
 
 
186 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  43.66 
 
 
162 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
160 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 
160 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
220 aa  123  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 
219 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  46.56 
 
 
160 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  45.8 
 
 
160 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 
167 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  45.8 
 
 
160 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  43.37 
 
 
167 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  37.72 
 
 
160 aa  121  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
175 aa  121  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 
166 aa  121  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  36.48 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  35.46 
 
 
162 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  48.99 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 
160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 
166 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 
209 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
292 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  30.63 
 
 
161 aa  117  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  40 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  40.61 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  40.71 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  43.97 
 
 
191 aa  116  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  50.77 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  46.27 
 
 
259 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 
166 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 
160 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 
174 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 
170 aa  114  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  42.42 
 
 
160 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  51.2 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0847  dihydrofolate reductase  41.56 
 
 
159 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0623  dihydrofolate reductase  41.01 
 
 
167 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  35.22 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 
337 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  36.55 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  35.34 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  39.19 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  43.51 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  34.1 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  35.34 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  38.04 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  38.04 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  37.41 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  40.91 
 
 
160 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  34.59 
 
 
162 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
172 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 
166 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>