266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3019 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  100 
 
 
194 aa  393  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  72.68 
 
 
194 aa  299  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  50.87 
 
 
181 aa  191  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  52.35 
 
 
175 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  51.72 
 
 
186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  52.57 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  49.42 
 
 
168 aa  160  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  50.3 
 
 
164 aa  157  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 
164 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
164 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 
166 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  46.02 
 
 
166 aa  154  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  52.86 
 
 
162 aa  150  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  49.42 
 
 
161 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 
164 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  48.84 
 
 
167 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  48.84 
 
 
161 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  47.93 
 
 
176 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  47.65 
 
 
167 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  47.09 
 
 
158 aa  148  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  45.29 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  43.68 
 
 
160 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  43.75 
 
 
177 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  42.53 
 
 
169 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  43.35 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  43.24 
 
 
185 aa  131  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  43.02 
 
 
162 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  44 
 
 
168 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  51.11 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  40.48 
 
 
163 aa  124  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  43.93 
 
 
174 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
172 aa  120  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
172 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
160 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  48.2 
 
 
187 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  44 
 
 
164 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 
160 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  34.88 
 
 
161 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  41.33 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 
160 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  40 
 
 
160 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  44.78 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 
160 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  40 
 
 
160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 
160 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  34.86 
 
 
171 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 
173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  44.74 
 
 
169 aa  111  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  37.58 
 
 
160 aa  111  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  42.03 
 
 
259 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 
166 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  38.79 
 
 
160 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  39.51 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  40.85 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  42.75 
 
 
160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  40.79 
 
 
161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  40.61 
 
 
160 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 
159 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  38.78 
 
 
160 aa  109  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  35.96 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  43.24 
 
 
172 aa  108  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 
160 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  35.67 
 
 
172 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  39.2 
 
 
171 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  38.67 
 
 
175 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  40.54 
 
 
162 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  42.61 
 
 
292 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  41.91 
 
 
160 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  38 
 
 
161 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  42.03 
 
 
167 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  36.78 
 
 
167 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  36.78 
 
 
167 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  40.56 
 
 
173 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  36.26 
 
 
162 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  42.75 
 
 
163 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  39.11 
 
 
173 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  40.91 
 
 
195 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
164 aa  104  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  42.41 
 
 
163 aa  104  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  40.58 
 
 
167 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  38.69 
 
 
172 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  37.08 
 
 
176 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  36.26 
 
 
183 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  40.58 
 
 
167 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  35.84 
 
 
160 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  39.44 
 
 
167 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0770  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 
162 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0847  dihydrofolate reductase  44.52 
 
 
159 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  43.05 
 
 
166 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 
162 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
171 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>