267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0770 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0770  dihydrofolate reductase  100 
 
 
162 aa  338  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  44.59 
 
 
162 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  46.45 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  41.22 
 
 
164 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.23 
 
 
163 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  41.89 
 
 
161 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  41.77 
 
 
161 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  41.77 
 
 
161 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  39.1 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  42.48 
 
 
160 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  42.57 
 
 
172 aa  117  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  40.91 
 
 
160 aa  117  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  42.48 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  44.9 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  43.51 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  43.14 
 
 
174 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 
162 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  42.47 
 
 
167 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  43.38 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  44.6 
 
 
166 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  44.27 
 
 
163 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  40.38 
 
 
183 aa  111  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  40.52 
 
 
160 aa  110  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  40.14 
 
 
172 aa  110  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  41.36 
 
 
164 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  42.21 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  43.71 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  41.5 
 
 
167 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1314  dihydrofolate reductase  33.1 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  43.61 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  38.13 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  39.24 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  38.13 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  39.19 
 
 
161 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  42.21 
 
 
172 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  41.56 
 
 
160 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  39.26 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  41.48 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0378  dihydrofolate reductase FolA  39.16 
 
 
163 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
166 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  40.82 
 
 
167 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  38.55 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0831  dihydrofolate reductase  35.67 
 
 
171 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000151073  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 
162 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 
162 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 
162 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 
170 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 
162 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 
162 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  39.62 
 
 
161 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  38.31 
 
 
160 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  40.91 
 
 
191 aa  107  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  41.29 
 
 
160 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  38.75 
 
 
164 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 
162 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 
162 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  40.12 
 
 
164 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  41.56 
 
 
160 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  40.27 
 
 
165 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 
170 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  41.01 
 
 
180 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 
169 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  41.98 
 
 
177 aa  106  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  38.71 
 
 
163 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  40.13 
 
 
166 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  40.67 
 
 
167 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  40.67 
 
 
167 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  40.67 
 
 
167 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  39.88 
 
 
171 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  41.56 
 
 
167 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 
170 aa  105  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  40.4 
 
 
169 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  40.67 
 
 
167 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  37.82 
 
 
187 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  40.67 
 
 
167 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  40.67 
 
 
167 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 
170 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  40.4 
 
 
169 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  40.79 
 
 
166 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  48.39 
 
 
160 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  41.56 
 
 
160 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  41.56 
 
 
160 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  39.16 
 
 
194 aa  104  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  38.16 
 
 
259 aa  104  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  41.56 
 
 
160 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  40 
 
 
167 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  38.06 
 
 
161 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  43.7 
 
 
164 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  40 
 
 
162 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
176 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 
167 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 
167 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>