272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2542 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 172 aa  347  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  91.28 
 
 		 172 aa  324  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  59.15 
 
 		 174 aa  207  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  55.62 
 
 		 167 aa  204  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  53.05 
 
 		 172 aa  194  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  53.05 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  54.17 
 
 		 173 aa  190  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  51.53 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  52.12 
 
 		 187 aa  187  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  47.93 
 
 		 166 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  48.47 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  47.34 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  47.93 
 
 		 166 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  52.48 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  52.48 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 169 aa  154  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  51.06 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  46.99 
 
 		 219 aa  148  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  47.93 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  50.72 
 
 		 170 aa  147  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  47.24 
 
 		 163 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  44.31 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  50.72 
 
 		 171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 165 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 164 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  48.97 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  44.17 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  46.81 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  50.72 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 179 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 195 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  42.33 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  48.23 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  41.57 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  43.11 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 179 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  45.07 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  43.92 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  51.11 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  45.75 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  37.95 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  39.76 
 
 		 161 aa  134  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  45.77 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  42.57 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  42.57 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  44.37 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  42.57 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>