267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0847 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0847  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2043  dihydrofolate reductase  85.53 
 
 		 159 aa  261  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0389  dihydrofolate reductase  84.91 
 
 		 159 aa  260  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  62.42 
 
 		 163 aa  204  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  48.25 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 219 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 209 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  45.91 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.45 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 195 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  43.31 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  43.31 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  45.86 
 
 		 337 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  42.67 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  42.41 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  42.96 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  43.92 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  48.25 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 		 259 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  41.77 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  46.21 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  43.92 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  44.93 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  42.07 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  43.07 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  44.2 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  38.27 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  38.27 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  44.93 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  41.55 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  46.97 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  44.93 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  45.77 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  47.74 
 
 		 173 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  44.59 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  43.07 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  44.2 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  44.2 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  42.18 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  39.88 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.8 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  38.04 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  43.64 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  40.28 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  42.45 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  39.51 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  44.59 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  42.75 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  36.02 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  44.52 
 
 		 194 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  40.52 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  34.55 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  42.34 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  43.61 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>