264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3387 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 171 aa  349  8.999999999999999e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  57.76 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  58.64 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  51.85 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  52.44 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  52.1 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 170 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  52.1 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  50.6 
 
 		 166 aa  153  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  50.96 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  51.92 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  51.46 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  50.59 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  49.71 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 180 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 172 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 172 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  46.91 
 
 		 178 aa  147  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  49.04 
 
 		 178 aa  147  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  51.28 
 
 		 171 aa  147  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  46.58 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 170 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  48.85 
 
 		 164 aa  143  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  49.36 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  46.5 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  47.47 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  52.87 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  48.72 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  49.03 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  51.75 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  47.13 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 173 aa  133  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  45.16 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  46.1 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 209 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  43.59 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 183 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  42.24 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  53.24 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 196 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 196 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.94 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  44.44 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>