266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3786 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 162 aa  317  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  62.58 
 
 		 165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  60 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  61.49 
 
 		 292 aa  169  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  56.17 
 
 		 166 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  54.32 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  56.17 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  58.49 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  56.17 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  52.98 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  53.89 
 
 		 173 aa  158  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  52.69 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  56.1 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  50.32 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  53.42 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  51.79 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  51.9 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  50.61 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  53.75 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  53.16 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  48.41 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 171 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  49.37 
 
 		 167 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 		 169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 177 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 		 166 aa  143  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  52.94 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  45.57 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  50.92 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  46.79 
 
 		 172 aa  141  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  44.94 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  46.79 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 195 aa  137  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 187 aa  137  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 171 aa  136  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  50.32 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  47.65 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  50.68 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  44.76 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 174 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  47.47 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  37.97 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 160 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 209 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  41.46 
 
 		 167 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  37.34 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  48.28 
 
 		 172 aa  130  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 		 183 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 177 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>