267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1855 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
171 aa  348  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  65.61 
 
 
161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  49.08 
 
 
177 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  53.99 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  52.83 
 
 
166 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  50 
 
 
164 aa  158  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  54.09 
 
 
166 aa  158  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 
175 aa  157  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
172 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  45.68 
 
 
162 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  50.94 
 
 
166 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  46.01 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 
172 aa  153  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  48.77 
 
 
163 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 
163 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 
162 aa  151  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 
162 aa  151  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 
162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 
162 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 
162 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 
162 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 
162 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 
162 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 
162 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 
162 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  48.43 
 
 
183 aa  149  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 
162 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 
160 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  45.51 
 
 
167 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 
188 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
161 aa  147  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 
165 aa  148  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
161 aa  147  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  41.88 
 
 
161 aa  147  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  48.39 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 
166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  48.68 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  43.4 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
159 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  51.7 
 
 
159 aa  144  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  0.0000505034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
160 aa  143  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  51.45 
 
 
160 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  44.94 
 
 
160 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  40.59 
 
 
171 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  51.45 
 
 
160 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 
171 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.06 
 
 
162 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.4 
 
 
167 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  43.59 
 
 
160 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  43.95 
 
 
160 aa  141  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 
161 aa  141  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  46.79 
 
 
176 aa  140  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  50.36 
 
 
160 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  49.28 
 
 
160 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  49.28 
 
 
160 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 
170 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  48.55 
 
 
160 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  43.71 
 
 
173 aa  138  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 
160 aa  138  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  48.55 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  44.31 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 
195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 
174 aa  137  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 
165 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
161 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  48.75 
 
 
163 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  50.36 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  43.59 
 
 
160 aa  133  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  47.37 
 
 
168 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  46.38 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  40.24 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
163 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  41.14 
 
 
159 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  41.14 
 
 
159 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  42.58 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  40.37 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  46.25 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 
178 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  46.15 
 
 
180 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  40.26 
 
 
155 aa  130  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  41.57 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 
161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  50.7 
 
 
160 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  41.51 
 
 
167 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>