265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04648 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 164 aa  333  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  60.98 
 
 		 163 aa  202  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  60.98 
 
 		 188 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  60.37 
 
 		 166 aa  194  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 183 aa  159  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 171 aa  158  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 		 173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  50.62 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 172 aa  147  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  48.85 
 
 		 171 aa  143  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 219 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 195 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  49.1 
 
 		 178 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  44.23 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 172 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 176 aa  140  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  44.72 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  42.17 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  44.23 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  44.31 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  42.01 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  40.13 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  44.87 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  44.79 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  38.27 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  43.17 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  41.03 
 
 		 160 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  39.62 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  44.79 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  34.76 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  39.62 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  40.27 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  48.55 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>