267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0351 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 171 aa  353  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  47.65 
 
 		 171 aa  167  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  48.54 
 
 		 169 aa  163  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  48.81 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  48.81 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  47.37 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 172 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  49.71 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  44.12 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  48.81 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  54.42 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 172 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 		 170 aa  157  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  43.53 
 
 		 178 aa  154  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  53.06 
 
 		 171 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  46.78 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  53.06 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 167 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  45.61 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  51.75 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 163 aa  148  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 219 aa  147  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  40.59 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  40.59 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  52.45 
 
 		 168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 162 aa  144  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  40.35 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  39.41 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  39.29 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  47.13 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 178 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 170 aa  140  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  43.11 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 209 aa  140  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  39.18 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  41.04 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.9 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  41.76 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  40.35 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  40.35 
 
 		 163 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  39.77 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 198 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 195 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 165 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  44.83 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  37.57 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  39.29 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  37.43 
 
 		 160 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  38.6 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>