268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5005 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 171 aa  347  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  99.42 
 
 		 171 aa  346  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  93.53 
 
 		 171 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  87.65 
 
 		 171 aa  307  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  74.85 
 
 		 170 aa  261  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  75 
 
 		 170 aa  260  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  74.27 
 
 		 170 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  70.18 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  66.47 
 
 		 171 aa  227  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  67.47 
 
 		 168 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  66.87 
 
 		 168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 195 aa  167  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 169 aa  163  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  53.74 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  51.35 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  52.48 
 
 		 172 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 160 aa  154  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 166 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  50.68 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  52.38 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  53.06 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  47.8 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  52.26 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  45.78 
 
 		 159 aa  147  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  50.35 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  44.59 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  43.53 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  45.12 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  49.31 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  49.32 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 162 aa  141  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  50.66 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  49.25 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  47.26 
 
 		 162 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.32 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  42.95 
 
 		 161 aa  138  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 162 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 162 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  48.99 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  46.31 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  40.62 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  51.75 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  42.61 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  46.31 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>