267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1031 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  48.25 
 
 		 175 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  43.89 
 
 		 171 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  47.22 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  47.18 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  45.89 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  48.23 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  38.65 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  46.48 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  48.23 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  44.68 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  48.23 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  47.79 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  45.52 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  52.85 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  39.77 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  52.85 
 
 		 161 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  39.52 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  52.03 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  38.18 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  38.92 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  52.8 
 
 		 160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  42.18 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  42.54 
 
 		 166 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  39.26 
 
 		 169 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  45.99 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  36.59 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  41.43 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  44.83 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0770  dihydrofolate reductase  40.91 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  38.18 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  42.03 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  43.97 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  41.06 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0623  dihydrofolate reductase  38.24 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  43.62 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  36.9 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  42.54 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0847  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 159 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  39.73 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  37.72 
 
 		 166 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  39.85 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  38.32 
 
 		 166 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  40.71 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  43.51 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2043  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  46.21 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  40.4 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  41.01 
 
 		 194 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  37.8 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  42.65 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  42.18 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0389  dihydrofolate reductase  36.93 
 
 		 159 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  38.32 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  38.06 
 
 		 161 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  35.07 
 
 		 162 aa  99.4  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  35.56 
 
 		 161 aa  99.4  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  36.31 
 
 		 163 aa  98.6  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  38.24 
 
 		 164 aa  98.6  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  42.03 
 
 		 168 aa  98.6  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  40.71 
 
 		 163 aa  97.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  35.85 
 
 		 159 aa  97.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 		 162 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  40.58 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  35.07 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0831  dihydrofolate reductase  36.96 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  41.13 
 
 		 165 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  34.33 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  37.09 
 
 		 159 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  35.93 
 
 		 164 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  39.1 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  35.54 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  33.58 
 
 		 162 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 163 aa  95.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0757  dihydrofolate reductase  34.73 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  41.48 
 
 		 259 aa  95.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  33.58 
 
 		 162 aa  94.4  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  33.58 
 
 		 162 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  33.58 
 
 		 162 aa  94.4  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  33.58 
 
 		 162 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>