267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1013 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  100 
 
 
170 aa  356  8e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  43.64 
 
 
162 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0757  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  41.72 
 
 
163 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  38.65 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  38.65 
 
 
167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  39.18 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  39.41 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  37.58 
 
 
164 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  40.7 
 
 
177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1270  dihydrofolate reductase  35.98 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000534166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0623  dihydrofolate reductase  37.8 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  39.39 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  38.27 
 
 
162 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  39.16 
 
 
167 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 
165 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  37.28 
 
 
167 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 
166 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  38.65 
 
 
191 aa  122  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  34.71 
 
 
166 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  36.69 
 
 
167 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  39.26 
 
 
171 aa  120  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0831  dihydrofolate reductase  40 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000151073  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  36.14 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  37.13 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  36.59 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  37.13 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  38.01 
 
 
167 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  37.58 
 
 
161 aa  117  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  37.58 
 
 
161 aa  117  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 
172 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1314  dihydrofolate reductase  32.1 
 
 
164 aa  117  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  36.75 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  36.75 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  37.5 
 
 
171 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  40.13 
 
 
173 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
159 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  36.31 
 
 
158 aa  114  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
159 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
159 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
159 aa  114  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  35.5 
 
 
161 aa  114  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  39.02 
 
 
159 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  39.62 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  39.35 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2332  dihydrofolate reductase  36.26 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  36.69 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  34.73 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  34.5 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  33.74 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  34.73 
 
 
167 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  34.73 
 
 
167 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  33.73 
 
 
167 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 
162 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  37.8 
 
 
163 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  34.73 
 
 
167 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  34.73 
 
 
167 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  34.73 
 
 
167 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  37.35 
 
 
170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4255  Dihydrofolate reductase  37.42 
 
 
167 aa  111  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
162 aa  111  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  34.36 
 
 
166 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  36.81 
 
 
159 aa  111  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
196 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  34.97 
 
 
160 aa  111  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  37.2 
 
 
183 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  35.71 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  36.53 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  36.09 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  36.53 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  39.35 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 
166 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 
166 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  35.26 
 
 
187 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  36.53 
 
 
166 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 
165 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  35.5 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>