265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2332 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2332  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 193 aa  404  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2012  dihydrofolate reductase  67.02 
 
 		 188 aa  276  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2315  dihydrofolate reductase  65.8 
 
 		 190 aa  273  8e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  34.95 
 
 		 173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  38.71 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  38.92 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  36.26 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  37.36 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  37.63 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 		 169 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  33.87 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  38.17 
 
 		 160 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  37.36 
 
 		 172 aa  111  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  42.76 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  35.48 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 163 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  34.95 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  36.17 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  37.36 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  38.98 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  37.1 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  35.68 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  37.63 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  34.44 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  36.56 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  34.21 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  34.44 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  34.95 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  38.5 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  34.43 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  38.5 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  34.44 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  41.56 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  32.62 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  34.25 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  37.97 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  34.05 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  34.07 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  37.1 
 
 		 160 aa  104  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  34.41 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  33.69 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  35.14 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  34.78 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  33.69 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  32.8 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  36.51 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  37.43 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  32.79 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  34.25 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  34.76 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  35.68 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  36.94 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  36.22 
 
 		 167 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  34.62 
 
 		 170 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  32.29 
 
 		 194 aa  101  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  34.97 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  33.71 
 
 		 166 aa  101  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  35.52 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  32.63 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  32.63 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  34.39 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  33.88 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  34.43 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  34.05 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1926  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  36.52 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  36.54 
 
 		 170 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  33.7 
 
 		 161 aa  99  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  33.9 
 
 		 171 aa  99  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  34.21 
 
 		 160 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  35.75 
 
 		 164 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  34.21 
 
 		 162 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  34.78 
 
 		 162 aa  97.8  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  33.16 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  31.18 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  34.64 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  32.07 
 
 		 161 aa  96.7  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  41.56 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  33.7 
 
 		 161 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 159 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 159 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  34.52 
 
 		 166 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  33.69 
 
 		 337 aa  94.7  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  34.52 
 
 		 166 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  31.69 
 
 		 171 aa  94.7  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  33.7 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  35.68 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  33.15 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  34.39 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  35.14 
 
 		 161 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  33.51 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  31.35 
 
 		 159 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  35.68 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  32.07 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>