263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4255 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4255  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 167 aa  346  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  39.1 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  39.1 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  39.1 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  39.1 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  39.1 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 159 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  39.74 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  43.97 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  43.97 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  36.6 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  36.6 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  41.03 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  37.8 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  37.89 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  41.03 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  39.22 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  38.31 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  36.6 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  33.53 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  39.87 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  38.56 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  36.88 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  36.25 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 		 195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  38.16 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  35.4 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  34.55 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  37.91 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  34.38 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  34.38 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  37.65 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  36.18 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  38.89 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  33.73 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  38.62 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  39.26 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  34.59 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  37.72 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  35.22 
 
 		 172 aa  111  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  33.75 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  37.35 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  34.36 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  37.13 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  36.65 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  36.09 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  37.66 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  36.42 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  40.15 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  36.42 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  41.84 
 
 		 306 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  35.15 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  34.87 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  38.65 
 
 		 259 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  36.75 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  38.61 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  33.33 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  34.78 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  37.91 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>