283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2799 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  100 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  88.89 
 
 		 306 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  51.28 
 
 		 163 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  54.49 
 
 		 161 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  54.61 
 
 		 160 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  48.46 
 
 		 162 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  48.46 
 
 		 162 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  48.46 
 
 		 162 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  48.46 
 
 		 162 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  48.46 
 
 		 162 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  48.46 
 
 		 162 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  48.46 
 
 		 162 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  48.46 
 
 		 162 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  47.69 
 
 		 162 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  48.46 
 
 		 162 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  47.69 
 
 		 162 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  49.62 
 
 		 162 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 161 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 165 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 161 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 165 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 167 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  47.29 
 
 		 161 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  47.29 
 
 		 161 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  43.4 
 
 		 159 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 159 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  49.65 
 
 		 166 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 172 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  46.51 
 
 		 161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  46.79 
 
 		 161 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  47.89 
 
 		 163 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  39.2 
 
 		 183 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  42.14 
 
 		 162 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1890  dihydrofolate reductase region  45.65 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  47.66 
 
 		 160 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  45.93 
 
 		 169 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 171 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  43.26 
 
 		 160 aa  125  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 160 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.51 
 
 		 163 aa  125  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 160 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  41.4 
 
 		 160 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 177 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 160 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 		 170 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  39.31 
 
 		 173 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  42.34 
 
 		 164 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  45.26 
 
 		 168 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 164 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  47.29 
 
 		 160 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  43.59 
 
 		 171 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  46.03 
 
 		 167 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  46.03 
 
 		 167 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 		 160 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  45.86 
 
 		 160 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  45.86 
 
 		 160 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 		 170 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 167 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  46.09 
 
 		 160 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 176 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 167 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 		 170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  45.11 
 
 		 160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 163 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  43.94 
 
 		 160 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  45.52 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  40.51 
 
 		 159 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  42.34 
 
 		 160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  41.14 
 
 		 160 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  41.51 
 
 		 167 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 167 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  38.18 
 
 		 172 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 165 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  48.48 
 
 		 177 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  45.11 
 
 		 160 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  43.14 
 
 		 169 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 171 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  40.85 
 
 		 175 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 		 161 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4255  Dihydrofolate reductase  41.84 
 
 		 167 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245302 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  38.18 
 
 		 172 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 		 169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 159 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  41.14 
 
 		 160 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 159 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 159 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 159 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 159 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  40.71 
 
 		 166 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 163 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  41.91 
 
 		 160 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  39.24 
 
 		 159 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  39.24 
 
 		 159 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  39.24 
 
 		 159 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  43.28 
 
 		 170 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  39.24 
 
 		 159 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  39.24 
 
 		 159 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  39.24 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.57 
 
 		 166 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  39.24 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>