267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0831 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0831  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 171 aa  355  9.999999999999999e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  41.07 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1314  dihydrofolate reductase  36.9 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  38.92 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  37.95 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  36.09 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1270  dihydrofolate reductase  36.9 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000534166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0757  dihydrofolate reductase  35.12 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  36.9 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  37.13 
 
 		 162 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  36.53 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0770  dihydrofolate reductase  35.67 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  34.34 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  35.93 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  32.94 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  34.52 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  33.13 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  35.12 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  35.15 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0378  dihydrofolate reductase FolA  35.71 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  34.76 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  34.34 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  33.73 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  31.17 
 
 		 171 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  32.74 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  32.73 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  31.33 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  35.5 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  32.75 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  30.77 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  33.53 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  33.76 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  36.08 
 
 		 177 aa  97.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  33.73 
 
 		 166 aa  97.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  31.95 
 
 		 164 aa  97.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  33.14 
 
 		 166 aa  97.1  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  34.55 
 
 		 162 aa  97.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  33.53 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  33.13 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  36.96 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  33.53 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  33.53 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  33.93 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 164 aa  96.7  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  30.36 
 
 		 162 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  33.77 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  31.79 
 
 		 337 aa  95.1  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  29.59 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  32.95 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  34.13 
 
 		 159 aa  94.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  35.93 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  35.5 
 
 		 196 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  35.93 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  35.5 
 
 		 196 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  35.93 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  35.93 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  35.93 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  29.7 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  28.14 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  35.93 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  31.18 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  34.5 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  35.5 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  32.54 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  32.54 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  32.54 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  31.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  30.12 
 
 		 292 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  29.59 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  32.54 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  34.94 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  32.54 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  31.95 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  32.54 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  33.14 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  31.33 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  33.89 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  30.11 
 
 		 181 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>