267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1002 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 161 aa  333  5.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  98.14 
 
 		 161 aa  330  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  81.76 
 
 		 159 aa  277  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  81.76 
 
 		 159 aa  277  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 161 aa  153  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 161 aa  153  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  43.57 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  40.72 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  42.55 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  39.51 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  42.04 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  37.89 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  42.57 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  37.27 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  40.51 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  40.51 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  37.89 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  35.98 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  36.71 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  40.51 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 209 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  40.76 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  35.4 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  39.22 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  38.31 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  45.26 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  42.54 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  0.0000505034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  37.8 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  38.85 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  36.84 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  37.8 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  37.67 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  40.6 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  41.35 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  38.65 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  40.6 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  37.97 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  37.67 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  36.59 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  34.94 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>