263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1270 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1270  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 173 aa  359  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000534166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1314  dihydrofolate reductase  51.53 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0623  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  35.98 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  38.32 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  37.2 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  37.95 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0831  dihydrofolate reductase  36.9 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  38.12 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  37.25 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl383  dihydrofolate reductase  36.3 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0297062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  38.55 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  35.8 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  34.16 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  35.12 
 
 		 167 aa  97.8  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0757  dihydrofolate reductase  32.3 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1681  Dihydrofolate reductase  35.37 
 
 		 181 aa  97.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  33.73 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  38.71 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  36.25 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  31.74 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  34.55 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  33.93 
 
 		 163 aa  94.7  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  35.03 
 
 		 161 aa  94  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  35.03 
 
 		 161 aa  94  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  37.8 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0884  dihydrofolate reductase  38.52 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  35.8 
 
 		 161 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0770  dihydrofolate reductase  33.78 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  41.13 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  33.93 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  33.92 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 163 aa  90.9  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  36.3 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  37.88 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  31.18 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  36.75 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  38.28 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  33.77 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  34.21 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  34.21 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  32.48 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  31.95 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  34.55 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  34.42 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  34.59 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 160 aa  88.2  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 160 aa  88.2  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 160 aa  88.2  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  35.82 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  31.06 
 
 		 161 aa  87.8  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  33.58 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  31.55 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1890  dihydrofolate reductase region  33.56 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  33.12 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  32.52 
 
 		 292 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  34.19 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  29.24 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  34.57 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  33.79 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  34.94 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  32.32 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  31.87 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 		 167 aa  85.9  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 		 167 aa  85.9  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  34.16 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  31.65 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  34.42 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  29.24 
 
 		 191 aa  85.1  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  34.64 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  0.0000505034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  33.94 
 
 		 170 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  33.75 
 
 		 160 aa  84.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  34.55 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  36.81 
 
 		 173 aa  84  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  30.56 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  30.3 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  34.18 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  32.45 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  33.95 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1653  Dihydrofolate reductase  33.07 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  30.26 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  32.68 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  31.55 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>