267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2031 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  330  7.000000000000001e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  0.0000505034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  51.7 
 
 
171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  48.06 
 
 
162 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  45.64 
 
 
172 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  50.39 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  55.64 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  43.87 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  42.65 
 
 
162 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  47.66 
 
 
164 aa  131  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  45.53 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  45.53 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  39.24 
 
 
163 aa  127  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  46.04 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.71 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.83 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 
170 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.86 
 
 
159 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  42.54 
 
 
161 aa  123  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  42.19 
 
 
167 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  42.19 
 
 
167 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  47.14 
 
 
177 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  47.18 
 
 
166 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  48 
 
 
160 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  44.83 
 
 
166 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  43.15 
 
 
165 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  41.04 
 
 
161 aa  120  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  44.19 
 
 
155 aa  120  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  43.31 
 
 
160 aa  120  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  42.54 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  44.78 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  41.13 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  46.97 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  45 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  42.74 
 
 
161 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  40.52 
 
 
292 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  42.47 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  44.2 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  38.35 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  42.52 
 
 
160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  47.01 
 
 
180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  40.82 
 
 
159 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  37.66 
 
 
171 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  48 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  41.27 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  46.21 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  41.73 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  39.6 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  42.52 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  43.66 
 
 
159 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  43.66 
 
 
159 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  43.66 
 
 
159 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.07 
 
 
167 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  41.79 
 
 
160 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  43.66 
 
 
159 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  43.66 
 
 
159 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  40.94 
 
 
160 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  40.41 
 
 
164 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  39.1 
 
 
166 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  43.2 
 
 
167 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  43.45 
 
 
166 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  43.38 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  40.54 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  39.19 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  43.06 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  41.78 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  38.26 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  43.18 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  42.96 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  43.06 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
160 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
160 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  38.71 
 
 
167 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
160 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  43.2 
 
 
183 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>