263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1314 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1314  dihydrofolate reductase  100 
 
 
164 aa  342  1e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0623  dihydrofolate reductase  54.88 
 
 
167 aa  203  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1270  dihydrofolate reductase  51.53 
 
 
173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000534166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  38.41 
 
 
162 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  42.58 
 
 
162 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  41.94 
 
 
162 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  41.94 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  41.29 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  41.29 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  41.29 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  41.29 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  41.29 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  41.29 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  41.29 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  38.51 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  39.35 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  36.25 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  38.18 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  38.85 
 
 
162 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  38.22 
 
 
165 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0757  dihydrofolate reductase  34.94 
 
 
165 aa  120  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  35.58 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  35.58 
 
 
166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0831  dihydrofolate reductase  36.9 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000151073  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  38.36 
 
 
172 aa  117  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  32.1 
 
 
170 aa  117  7.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  35.15 
 
 
167 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  37.25 
 
 
161 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  37.25 
 
 
161 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  32.72 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 
183 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  31.9 
 
 
171 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  36.71 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  32.1 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  35.93 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  35.62 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  33.12 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  36.25 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  34.12 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  34.57 
 
 
163 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  33.95 
 
 
174 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0770  dihydrofolate reductase  33.1 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  35.62 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  33.76 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  32.91 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 
160 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  34.39 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  33.76 
 
 
169 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  35.76 
 
 
171 aa  107  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  40 
 
 
161 aa  107  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  33.76 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  36.13 
 
 
164 aa  107  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
161 aa  107  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  37.01 
 
 
165 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  36.77 
 
 
166 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  34.73 
 
 
178 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  33.12 
 
 
292 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 
167 aa  104  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 
161 aa  103  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 
161 aa  103  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  31.93 
 
 
172 aa  103  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  36.65 
 
 
164 aa  103  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  29.41 
 
 
172 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  32.93 
 
 
161 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  35.97 
 
 
176 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  31.9 
 
 
164 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  35 
 
 
162 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  31.85 
 
 
167 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl383  dihydrofolate reductase  34.03 
 
 
161 aa  102  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0297062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1681  Dihydrofolate reductase  35.29 
 
 
181 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  30.61 
 
 
161 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  34.9 
 
 
166 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 
166 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 
167 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  30.49 
 
 
171 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
167 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
167 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  34.84 
 
 
173 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  33.78 
 
 
168 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  31.45 
 
 
187 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  34.76 
 
 
179 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  36.17 
 
 
167 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  32.08 
 
 
162 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  32.91 
 
 
178 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 
167 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 
167 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 
167 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  32.47 
 
 
160 aa  100  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 
167 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 
167 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  34.19 
 
 
219 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  33.12 
 
 
163 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  32.34 
 
 
178 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  34.59 
 
 
166 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  33.53 
 
 
259 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>