267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0389 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0389  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 159 aa  318  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2043  dihydrofolate reductase  97.48 
 
 		 159 aa  295  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0847  dihydrofolate reductase  84.91 
 
 		 159 aa  261  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  59.24 
 
 		 163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 219 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  49.32 
 
 		 171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  49.68 
 
 		 337 aa  126  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 209 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  45.91 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  41.77 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  40.51 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 259 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  35.8 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  41.55 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  43.15 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  39.26 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  43.88 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  45.26 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  45.26 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  45.26 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  45.26 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  45.26 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  42.25 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.2 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  46.32 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  37.33 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  44.9 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  42.66 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  43.17 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  42.18 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  41.55 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  44.85 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  38.89 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  35.8 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  35.8 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  39.44 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  44.37 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  44.2 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  43.54 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 		 195 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  42.45 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  47.69 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  45.77 
 
 		 178 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  46.81 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  44.22 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  40.71 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  41.78 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  39.78 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  43.17 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  41.1 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  43.17 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  37.34 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  38.27 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  42.45 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  42.45 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  46.72 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  41.78 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  42.34 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  42.03 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 196 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>