266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  59.3 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  55.56 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  52.87 
 
 		 194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  54.39 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  53.71 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 167 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  53.53 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  52.35 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  48.54 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  46.24 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  50.87 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  47.95 
 
 		 164 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  50 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 162 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  54.07 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  51.41 
 
 		 166 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  54.91 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  48.24 
 
 		 168 aa  141  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  49.12 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  49.12 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  48.54 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  43.27 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  43.86 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  50.38 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  51.88 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  50.38 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  50.38 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  41.32 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  40.46 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  41.52 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  40.46 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  49.23 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  47.67 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  47.48 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  52.63 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  49.63 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  48.84 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  48.84 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  48.84 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  48.84 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  48.84 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  48.85 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  42.86 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  48.06 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  41.07 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  41.25 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  41.57 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  39.05 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.93 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  37.87 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  43.94 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  41.42 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  44.2 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  37.59 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  42.07 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 292 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  36.97 
 
 		 159 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  37.87 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  38.01 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  38.01 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  46.51 
 
 		 219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 159 aa  114  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  42.26 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  37.08 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  37.58 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  37.93 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  34.55 
 
 		 163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  45.74 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>