267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2833 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
185 aa  362  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  44.62 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  43.46 
 
 
164 aa  135  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  48.75 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  43.92 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 
220 aa  132  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  46.94 
 
 
175 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  43.24 
 
 
194 aa  131  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  47.37 
 
 
166 aa  124  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  45.41 
 
 
167 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  45.57 
 
 
173 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  45.26 
 
 
160 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  43.31 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  43.92 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  46.77 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  45.08 
 
 
158 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  43.16 
 
 
162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  46.05 
 
 
162 aa  117  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  43.92 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  46.5 
 
 
166 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  43.24 
 
 
177 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  52.63 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  41.94 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  44.52 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  43.39 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  43.39 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  41.42 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  42.39 
 
 
292 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  41.76 
 
 
172 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  40.21 
 
 
181 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  45.14 
 
 
169 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  39.66 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  39.68 
 
 
195 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  41.28 
 
 
172 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 
166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  32.62 
 
 
160 aa  114  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 
166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  39.53 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  43.66 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  36.08 
 
 
161 aa  111  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  48.28 
 
 
169 aa  111  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  42.04 
 
 
164 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  40.54 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  38.59 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  38.59 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  37.57 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  40 
 
 
163 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 
171 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 
195 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  35.68 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  43.01 
 
 
168 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  40.48 
 
 
170 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  38.92 
 
 
167 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  41.24 
 
 
168 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  35.14 
 
 
160 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  39.46 
 
 
167 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2043  dihydrofolate reductase  40.86 
 
 
159 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  40 
 
 
161 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  39.36 
 
 
177 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  39.53 
 
 
176 aa  104  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 
187 aa  104  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  34.59 
 
 
160 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  38.85 
 
 
163 aa  104  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  34.05 
 
 
160 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  34.05 
 
 
160 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  32.42 
 
 
160 aa  104  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  38.59 
 
 
209 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  34.97 
 
 
183 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  34.24 
 
 
160 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  37.11 
 
 
183 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 
166 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  39.68 
 
 
167 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  40.91 
 
 
179 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  35.87 
 
 
160 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  34.41 
 
 
160 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  37.09 
 
 
171 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  39.68 
 
 
167 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  39.68 
 
 
167 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  39.68 
 
 
167 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  39.77 
 
 
170 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  39.68 
 
 
167 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0405  dihydrofolate reductase  35.61 
 
 
219 aa  101  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
162 aa  101  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  39.68 
 
 
167 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  34.22 
 
 
169 aa  101  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  42.38 
 
 
163 aa  101  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  38.59 
 
 
166 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  36.7 
 
 
166 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  40.24 
 
 
166 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  40.22 
 
 
219 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  38.8 
 
 
171 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  40.12 
 
 
172 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>