267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1790 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0405  dihydrofolate reductase  42.03 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  46.31 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  46.94 
 
 		 164 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  40.64 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  44.9 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  43.59 
 
 		 164 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  46.45 
 
 		 194 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  44.9 
 
 		 164 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  38.71 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  42.18 
 
 		 165 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  39.78 
 
 		 175 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  41.06 
 
 		 166 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  47.29 
 
 		 172 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 160 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  47.29 
 
 		 172 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  45.89 
 
 		 169 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  42.18 
 
 		 181 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  42.95 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 162 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  42.64 
 
 		 169 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  44 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  44 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  38.55 
 
 		 171 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.06 
 
 		 171 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 162 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  40.65 
 
 		 174 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  42.76 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 165 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  38.98 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 163 aa  114  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  40.49 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  42.76 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  40.97 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  40.97 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 		 175 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  42.66 
 
 		 166 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  37.13 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  32.61 
 
 		 161 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  38.1 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  39.11 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  46.62 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  40.29 
 
 		 162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  45.67 
 
 		 159 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 160 aa  111  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  43.08 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  41.43 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  44.88 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  45.11 
 
 		 168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  41.84 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  37.43 
 
 		 162 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  41.55 
 
 		 160 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  41.55 
 
 		 160 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  41.55 
 
 		 160 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 		 160 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  41.55 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 186 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 160 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 178 aa  108  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  41.33 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  43.31 
 
 		 160 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  40.65 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  42.52 
 
 		 160 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 		 195 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  41.45 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  45.11 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  38.78 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  43.18 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  36.69 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  41.73 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  43.31 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.31 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  36.17 
 
 		 160 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  40.41 
 
 		 166 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  38.92 
 
 		 167 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  40.97 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  39.86 
 
 		 167 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  43.31 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  40.56 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  37.1 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 160 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  38.89 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  39.22 
 
 		 163 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  39.73 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 171 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  36.17 
 
 		 171 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  37.21 
 
 		 162 aa  104  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 171 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  40.85 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  34.18 
 
 		 171 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>