260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0405 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0405  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  42.03 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  36.1 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  35.9 
 
 		 165 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  41.45 
 
 		 164 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  37.72 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  35.61 
 
 		 185 aa  101  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  37.43 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  40.79 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  38.32 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  40.79 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  35.93 
 
 		 158 aa  99  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  32.43 
 
 		 171 aa  99.4  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  46.46 
 
 		 167 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  36.41 
 
 		 167 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  46.46 
 
 		 161 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  46.46 
 
 		 161 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  34.45 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  38.32 
 
 		 168 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  40.13 
 
 		 164 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  34.03 
 
 		 164 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  37.91 
 
 		 166 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  42.76 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  30.92 
 
 		 161 aa  95.9  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 171 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  36.84 
 
 		 177 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  34.12 
 
 		 194 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  35.26 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  32.29 
 
 		 169 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  37.82 
 
 		 166 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  36.53 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  34.74 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  36.08 
 
 		 166 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  36.08 
 
 		 166 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  32.2 
 
 		 181 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  32.11 
 
 		 162 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  36.88 
 
 		 160 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  35.08 
 
 		 174 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  34.39 
 
 		 171 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  33.92 
 
 		 170 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  33.16 
 
 		 160 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  32.21 
 
 		 160 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  34.39 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  32.62 
 
 		 159 aa  89  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  36.31 
 
 		 173 aa  89  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 170 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  34.32 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  33.53 
 
 		 171 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 170 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  33.53 
 
 		 171 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  36.49 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  35.57 
 
 		 160 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  33.95 
 
 		 171 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  34.9 
 
 		 169 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  33.33 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  32.72 
 
 		 171 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  31.09 
 
 		 162 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  35.58 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  33.16 
 
 		 160 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 		 160 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  32 
 
 		 183 aa  85.9  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  31.55 
 
 		 160 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  31.21 
 
 		 163 aa  85.5  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  34.64 
 
 		 173 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  32.2 
 
 		 176 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  31.09 
 
 		 162 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  40.79 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  33.96 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  30.57 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  28.96 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  30.32 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  34.13 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  30.94 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  32.09 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  30.57 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  30.57 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  30.57 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  30.57 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  30.57 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  30.57 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  34.23 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  35.76 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  31.02 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1314  dihydrofolate reductase  29.14 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  32.72 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  29.74 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  33.11 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  34.67 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  32.21 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  34.23 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  29.21 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  35.26 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  33.73 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>