270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2988 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1681  Dihydrofolate reductase  79.66 
 
 		 181 aa  268  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  57.23 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  56.47 
 
 		 172 aa  181  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  44.31 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 163 aa  131  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  44.51 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 		 160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  47.4 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  40.51 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  41.42 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  43.18 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  40.69 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  41.52 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  44.16 
 
 		 178 aa  124  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.22 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  43.09 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  44.08 
 
 		 160 aa  124  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  124  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  43.33 
 
 		 160 aa  124  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 163 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  43.84 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  41.28 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  40.59 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  38.62 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.54 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  38.62 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  43.33 
 
 		 165 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  38.62 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  43.33 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  43.33 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  39.77 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  40.48 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  43.54 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  40.7 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  41.76 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  42.18 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  42.69 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  41.03 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  42.35 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.38 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  41.78 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  41.96 
 
 		 160 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  43.51 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  38.6 
 
 		 170 aa  117  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  40.48 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  41.76 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  39.05 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  35.76 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  39.07 
 
 		 161 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  41.07 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  42.47 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  42.03 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>