268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2167 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  100 
 
 		 194 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  54.5 
 
 		 183 aa  178  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  53.97 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1681  Dihydrofolate reductase  51.93 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 		 169 aa  135  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  41.24 
 
 		 163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  44.63 
 
 		 170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  44.94 
 
 		 170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  48.7 
 
 		 173 aa  131  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  41.24 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  37.21 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  41.34 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  42.76 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  43.93 
 
 		 160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  43.02 
 
 		 163 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  47.67 
 
 		 292 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  41.95 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.58 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  41.38 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  42.21 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  41.86 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  40.57 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  43.1 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  39.55 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  39.55 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  43.89 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  46.1 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 160 aa  124  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 160 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 160 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  41.45 
 
 		 160 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  38.98 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  40.54 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  37.28 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  40.51 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  42.04 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  43.36 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  41.14 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  40.59 
 
 		 161 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  40.51 
 
 		 160 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  42.21 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  42.29 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  44.57 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  42.95 
 
 		 171 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 160 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  44.26 
 
 		 180 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 160 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 161 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 161 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  42.61 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  44 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  38.46 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  43.1 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  41.52 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  42.2 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  44.57 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 161 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  40.35 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 169 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  41.28 
 
 		 172 aa  118  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 171 aa  118  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  46.94 
 
 		 174 aa  118  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  38.37 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  45.71 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  41.83 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  45.14 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  39.64 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  42.44 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  37.76 
 
 		 162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  39.29 
 
 		 164 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  43.1 
 
 		 166 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  43.43 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  41.86 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  45.09 
 
 		 166 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  41.95 
 
 		 166 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  41.62 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  39.77 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  45.77 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>