75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1355 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  100 
 
 		 118 aa  239  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 		 174 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  44.55 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  47.71 
 
 		 257 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.71 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.71 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  37.25 
 
 		 337 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  38.67 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  38.03 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  34.69 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  36.14 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  35.56 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  34.15 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  38.46 
 
 		 316 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  37.36 
 
 		 316 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  34.38 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  33.33 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  38.1 
 
 		 314 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.79 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  34.09 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  38.1 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0862  NUDIX family hydrolase  26.37 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000267263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  38.1 
 
 		 314 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  38.1 
 
 		 314 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  40.51 
 
 		 312 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  28.89 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0285  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 147 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.49 
 
 		 131 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49101  predicted protein  33.67 
 
 		 174 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00569442  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  28.89 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.17 
 
 		 131 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.17 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.17 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.96 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  31.11 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.17 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  31.76 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1336  NUDIX family hydrolase  33.64 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0415939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1352  NUDIX family hydrolase  33.64 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.11 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  33.64 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  28.89 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  37.1 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  32.26 
 
 		 315 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  35.71 
 
 		 313 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.03 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2023  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296194  normal  0.0882034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.81 
 
 		 129 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 143 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>