223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7147 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  48.81 
 
 		 169 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  43.79 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2947  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 		 163 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  27.91 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  39.36 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  37.23 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  25.86 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  29.28 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  32.26 
 
 		 177 aa  51.6  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 165 aa  51.2  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.54 
 
 		 346 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  27.65 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  28.98 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.9 
 
 		 346 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.54 
 
 		 345 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.54 
 
 		 345 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 325 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.9 
 
 		 346 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.9 
 
 		 346 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.9 
 
 		 346 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 		 132 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.9 
 
 		 346 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1423  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  30.41 
 
 		 330 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  36.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  35.42 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 146 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3170  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  44.59 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 338 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  35.79 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1837  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.24 
 
 		 367 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>