More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2673 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 166 aa  343  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  52.53 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2947  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  35.51 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.3 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  36.3 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.3 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.3 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  36.3 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.3 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  36.3 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  36.3 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  39.36 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  31.71 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  38.37 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  33.82 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  31.71 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  37.23 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  37.89 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  32.18 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  36.96 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  30.53 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  42.42 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  30.53 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  30.53 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  30.53 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  30.53 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  30.53 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  30.53 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  30.53 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  27.1 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  40.58 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>