113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3496 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 152 aa  313  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 303 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 303 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  48.21 
 
 		 325 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  28.95 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 341 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  28.37 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  42.86 
 
 		 292 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  34.74 
 
 		 424 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 289 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 322 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 229 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  38.6 
 
 		 336 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  37.84 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 216 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  41.67 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  41.67 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  40.98 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 322 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 229 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  41.38 
 
 		 305 aa  43.9  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 315 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  41.67 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  40.98 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  41.67 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  41.67 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  41.67 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  31.78 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  27.89 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  41.82 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 324 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  27.08 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  27.08 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  27.08 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  27.08 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  34.25 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  27.86 
 
 		 156 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 140 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 150 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 142 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 149 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 142 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 207 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  35.96 
 
 		 229 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 141 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  62.07 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  33.8 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  27.41 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  27.41 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  27.41 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 333 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.17 
 
 		 583 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  27.13 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  40 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  28.8 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  27.13 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  27.13 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  27.13 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0736  NTP pyrophosphohydrolase including oxidative damage repair enzyme  26.67 
 
 		 224 aa  40.8  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  27.13 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>