More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1059 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  73.81 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  67.33 
 
 		 216 aa  247  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  70.08 
 
 		 322 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  72.22 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 311 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 311 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 311 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  37.68 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  39.47 
 
 		 314 aa  68.6  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  40.68 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  30.99 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 299 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 142 aa  62  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 315 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  36.96 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  30.3 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  34.45 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 536 aa  55.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 351 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 301 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 430 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  30.89 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 302 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  38.75 
 
 		 258 aa  52.8  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  35.05 
 
 		 128 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 141 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 302 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 129 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  28.57 
 
 		 136 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  41.54 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  41.54 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  41.54 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  41.54 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  41.54 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  41.54 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  41.54 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  41.54 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  30.3 
 
 		 395 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  33.85 
 
 		 336 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  43.02 
 
 		 343 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  31.45 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 282 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 268 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  49.09 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  46.15 
 
 		 524 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 141 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 141 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 136 aa  48.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  34.96 
 
 		 308 aa  48.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 141 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>