86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1592 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  100 
 
 		 395 aa  813    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  41.53 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 324 aa  170  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  32.95 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  29.97 
 
 		 356 aa  159  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  34 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  33.71 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  30.99 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  30.79 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  33.61 
 
 		 317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  32.57 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  32.47 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  31.51 
 
 		 325 aa  123  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 302 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 315 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.76 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  31.6 
 
 		 289 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 296 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 322 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  29.82 
 
 		 301 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 140 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 		 151 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 149 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.26 
 
 		 577 aa  51.2  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 164 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 211 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 139 aa  50.4  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 216 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 143 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 195 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 140 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 158 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 139 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 143 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 137 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 		 143 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 142 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  34.62 
 
 		 172 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 146 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0862  NUDIX family hydrolase  29.55 
 
 		 147 aa  46.6  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000267263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 		 134 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  26.12 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 		 172 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 180 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0415  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 184 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  26.79 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  40.35 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  22.81 
 
 		 147 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 141 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 145 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 144 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.27 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 150 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 145 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.62 
 
 		 134 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 145 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 237 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  56.76 
 
 		 156 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 172 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 153 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 183 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 		 150 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.27 
 
 		 135 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 135 aa  43.1  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.27 
 
 		 135 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.27 
 
 		 135 aa  43.1  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  31.94 
 
 		 302 aa  42.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  29.27 
 
 		 135 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>