180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1481 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  46.69 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  46.78 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  46.44 
 
 		 311 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  46.44 
 
 		 311 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  44.86 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  45.05 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  49.13 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  45.64 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.9 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  40 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  40.75 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  39.1 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  36.36 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  39.19 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 322 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  35.47 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  33.69 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  32.03 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  32.46 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  30.26 
 
 		 395 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  32.55 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  34.68 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 149 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  32.77 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  32.06 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 139 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0088  phosphoglycerate mutase family protein  34.86 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  31.93 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 140 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 141 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 147 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.78 
 
 		 577 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 282 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  36.17 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 139 aa  52.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 148 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 151 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.61 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.91 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 142 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 142 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 151 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 182 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 152 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 144 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  36.13 
 
 		 182 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 137 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  31.45 
 
 		 155 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 229 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 142 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 144 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  25.71 
 
 		 137 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 166 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  24.55 
 
 		 141 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 141 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  31.65 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>