71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0081 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  100 
 
 		 398 aa  825    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  41.77 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  31.68 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  30.43 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  30.36 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  27.25 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  32.63 
 
 		 292 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  28.74 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  27.84 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 333 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  31.05 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  31.05 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  31.05 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.58 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 310 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  30.31 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 303 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  30.45 
 
 		 302 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 314 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  28.11 
 
 		 299 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  30.08 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  27.44 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  27.24 
 
 		 296 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 		 164 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  23.88 
 
 		 151 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 143 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  39.68 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  25.18 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 		 139 aa  47.4  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  24.22 
 
 		 147 aa  47.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 139 aa  47.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 183 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 150 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  24.2 
 
 		 149 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  25.79 
 
 		 237 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  23.91 
 
 		 140 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.81 
 
 		 134 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  25.9 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  25.9 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  25.9 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 140 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  24.84 
 
 		 153 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  38.03 
 
 		 208 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 440 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 135 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  40.82 
 
 		 229 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 135 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 135 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  23.75 
 
 		 145 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 134 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  43.14 
 
 		 153 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 153 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.18 
 
 		 135 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 		 164 aa  43.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>